วัดคลองพุทรา เดิมชื่อวัดคลองพุดซา สร้างขึ้นเมื่อปี พ.ศ. 2464 โดยมีคุณหญิงประเสริฐสาตร์ ดำรงทิพโกมลเวช เป็นผู้บริจาคที่ดินเพื่อสร้างวัด พร้อมทั้งได้รับความร่วมมือจากราษฎรบ้านระแวงในการบริจาคทรัพย์เพื่อสร้างเสนาสนะสำหรับที่พักสงฆ์และบำเพ็ญกุศล ส่วนที่ดินสำหรับเป็นที่ธรณีสงฆ์นั้น ได้รับการบริจาคจากนางใบ คุณทวี
วัดคลองพุทรามีสิ่งศักดิ์สิทธิ์ประจำวัดที่เป็นที่รู้จักและสักการะบูชา คือ หลวงพ่อดำ ซึ่งได้รับอนุญาตจากทางราชการให้ใช้พื้นที่วัดในการสอนหนังสือแก่เด็กนักเรียน และในปี พ.ศ. 2517 ยังได้รับอนุญาตให้ใช้พื้นที่ในการตั้งโรงเรียนวัดราษฎร์ศรัทธาธรรม วัดได้รับพระราชทานวิสุงคามสีมาเมื่อวันที่ 23 สิงหาคม พ.ศ. 2477 โดยมีเขตวิสุงคามสีมากว้าง 13 เมตร ยาว 26.20 เมตร